جمهوری اسلامی ایران مدارکی در اختیار دارد که بر اساس آنها مقامات آذربایجان مساعدت‌هایی به عوامل موساد و سیا داشته و این اقدام منجر به ترور دانشمندان هسته‌ای به خصوص احمدی‌روشن توسط عوامل این سازمان‌‌ها شده است.
رسانه حکومتی فارس 2اسفند1390، ازقول نایب رئیس کمیسیون امنیت مجلس آخوندی نوشت : در حال حاضر مقامات آذری چون نمی‌توانند از زیر بار مساعدت‌های خود به سازمان‌های جاسوسی بیگانه فرار کنند، لذا با فرار به جلو اعلام می‌کنند که تیم‌های تروریستی وابسته به ایران را بازداشت کرده‌ایم.