سایت حکومتی فارس در 7 فروردین 1390 خبر داد که حقوق مهدی هاشمی رفسنجانی رئیس دفتر هیأت امنای دانشگاه آزاد که از شهریور سال 88جهت بازدید و رسیدگی به دفاتر و شعبات دانشگاه آزاد در خارج از کشور از ایران خارج شده بود ا،  در سال 91 قطع شد.  مهدی هاشمی در مدت 19ماه که از مأموریت مهدی هاشمی به لندن می‌گذرد. ماهیانه بابت حقوق و حق مأموریت مبلغ 3200 پوند همراه با 4 میلیون تومان دریافت کرده است.
رفسنجانی رئیس هیأت امنای دانشگاه آزاد در خصوص علت سفر پسرش به لندن گفته بود: "ما در دانشگاه آزاد اسلامی شش واحد در خارج از کشور داریم که همه آنها مشکل دارند. می‌بایست کسی می‌رفت و رسیدگی می‌کرد. از لندن شروع کردیم و به لبنان رفتیم که باید توسعه پیدا کند. واحد دوبی مشکلات خاصی دارد. در زنگبار زمین دادند که هنوز نتوانستیم شروع کنیم. در ارمنستان و تاجیکستان هم واحد داریم. باید رسیدگی می‌کرد که رفت. دلش می‌خواهد بیاید و من می‌گویم اول کارهایت را تمام کن و انجام بده و بعد بیا. از این طرف هم مرتب تهمت می‌زنند که او هم همیشه جواب می‌دهد.
بر اساس اخبار موثق در دوره مدیریت جدید دانشگاه آزاد حقوق و حق مأموریت مهدی هاشمی قطع گریده است