ولی فقیه نظام طی سخنانی که کیهان شریعتمداری روز پنجشنبه متن کامل آن را به چاپ رسانده است گفت: «در بررسی سیاست های کلی انتخابات در مجمع تشخیص، نباید هیچ خدشه ای به جایگاه و اختیارات شورای نگهبان وارد شود».
به نوشته کیهان بخشهایی از سخنان خامنه ای در دیدار با اعضای مجلس در تاریخ 6 اسفند انجام شد, و دفتر خامنه ای روز 19 اسفند اقدام به انتشار آن کرده است, «به مسئله مهم مصوبه مجمع تشخیص در مورد انتخابات اختصاص دارد».  
مطابق سندی که توسط پایگاه اطلاع رسانی دفتر خامنه ای منتشر شده, خامنه ای گفت: «روی مسئله اصلی نظام و نقشه نظام و کلیت نظام هیچ اهمالی را نباید روا بداریم. مسائل درجه دومی وجود دارد که البته اینها را می توان حل کرد. حالا من دیدم مثلاً این روزها طرحی که در مجمع تشخیص است، مورد توجه است. البته معلوم است؛ این طرح وقتی که در مجمع تشخیص مطرح بشود، بالاخره نظر مجمع، نظر مشورتی است؛ این پیش ما خواهد آمد و آن چیزی را که معتقد ماست، اعمال می کنیم و به عنوان سیاست کلی گفته می شود».
خامنه ای نقش شورای نگهبان به ویژه «نظارت بر انتخابات و نشحیص صلاحیتها» که در قانون اساسی ولایت فقیه بر آن تصریح شده, را به عنوان پایه و اصل نظام مورد تأکید قرار داد و آن را غیر قابل تعرض دانست و گفت : «شکی نیست که شورای نگهبان وظایفی قانونی دارد. به این وظایف مصرّح در قانون اساسی - که نظارت بر انتخابات و تشخیص صلاحیتها و این چیزهاست - باید تعرض نشود. این چیزها را می شود اصلاح کرد. یعنی این قضیه را نباید مسئله مورد بحث و مورد دعوا و نزاع قرار داد».

خامنه ای در مهمترین فراز سخنان خود, بر قلب موضوع و بحرانی که رژیمش طی 9 ماه بعد از انتخابات با آن دست به گریبان است انگشت گذاشت و تأکید کرد که این قبیل دعواها دعواها و مسائل فرعی است, مسأله اصلی مسأله بود و نبود تمامیت نظام ولایت فقیه است که مورد دعوا و منازعه است و قیام مردم ایران در 9 ماه گذشته آن را هدف قرار داده و خواستار سرنگونی آن است و از همه جناحهای رژیمش خواست که تمام تلاش و سعی خودشان را برای مقابله با این خطر و برای حفظ نظام ولایت فقیه متمرکز کنند. خامنه ای گفت «اینها چیزهایی است که قابل اصلاح است. ممکن است در آنجا یک کسی خطائی هم بکند؛ خطا قابل جبران است. اینها مسائل اصلی نیست؛ مسئله اصلی همین مسائلی است که در طول این هشت نه ماه بعد از انتخابات، محل اختلاف بوده است بین مجموعه نظام اسلامی و مجموعه کفر و استکبار، که اینجا کسانی حرف های آنها را تکرار کردند. آنها می خواهند نظام اسلامی، نظام دینی، نظام مبتنی بر اطاعت از خدا و رسول وجود نداشته باشد. هر آن چیزی که تضمین کننده اطاعت عمومی این نظام است، برای آنها دشمن محسوب می شود؛ علیه اش اقدام می کنند، علیه اش فعالیت می کنند، همه تلاش خودشان را برای زدن آن متمرکز می کنند. این طرف قضیه باید تلاش و سعی خودش را بکند، برای اینکه همین ارکان اصلی را، این مبانی و مبادی اصلی را حفظ کند. مسئله اصلی را نباید مغفوأ عنه قرار داد».