درحالی که نفوذ سیاسی او به اوج خود رسیده است، مسئولان دیگر سرویسهای اطلاعاتی موجود در اسرائیل خیلی از او خوششان نمیآید. «شین بت» (سازمان امنیت داخلی اسرائیل) و «امان» (سازمان اطلاعات نظامی اسرائیل) میر داگان را متهم میکنند که او همه موفقیتها را به حساب خودش میگذارد و با آنها چندان همکاری نمیکند. مخالفان او میگویند که او به مقامش محکم چسبیده و کسانی که میتوانستهاند جانشین او بشوند را کنار گذاشته است. میر داگان از همه روسای پیشین سازمان موساد دوران ریاستش طولانیتر بوده است و او در نظر دارد هنوز چندین سال دیگر در این مقام باقی بماند. اخیرا او تخمین زده بود که ایران حداقل تا سال 2014 قادر نخواهد بود بمب اتمی تولید بکند. مخالفان او در آن زمان به کنایه گفته بودند که او امیدوار است که حداقل تا سال 2014 در راس موساد باقی بماند. نتانیاهو معتقد است که برنامه هستهای ایران یک تهدید جدی برای موجودیت اسرائیل است. نتانیاهو احتمالا دوره ریاست میر داگان را تمدید خواهد کرد زیرا به نظر او میرداگان کسی است که قادر خواهد بود با تهدیدهای رژیم تهران مقابله کرده و امنیت اسرائیل را تامین بکند.