وی به منفوریت کل نظام ولایت فقیه در میان مردم اعتراف کرد و گفت: «بسیاری از مردم و مسئولان» طرح «ولایت فقیه» خمینی را درک نکردهاند.
آخوند مصباح یزدی دعاوی فرعونی خمینی را تکرار کرد و افزود: از زمانی که بحث پیاده شدن ولایت فقیه در جامعه مطرح شد، خمینی گفت: من به وسیله ولایتی که از سوی خدا به من داده شده، دولت تعیین می کنم!