خامنه ای هم چنین به نقل و انتقال سرکردگان اصلی سپاه ضد محمد رسول الله که سرکوب خیزشها در تهران را برعهده دارد مبادرت کرده است.
بدنبال تغییر سرکرده امنیت این سپاه، رسانههای سپاه پاسداران اعلام کردند طی حکمی از سوی پاسدار جعفری، پاسدار محسن کاظمینی سرکرده سپاه ضد محمد رسولالله تهران بزرگ برکنار و پاسدار جنایتکار دیگری به نام محمدرضا یزدی جایگزین وی شد.
مأموریت این ارگان سرکوب قیامهای مردمی در تهران است و در جریان قیام مردم در سال ۸۸ نقش مهمی ایفا کرده است.