سخنگوی مجاهدین در مورد نسبت دادن انفجار در نطنز به سازمان مجاهدین خلق ایران گفت:
این کار مجاهدین نیست اما ما خواهان ایران بدون بمب اتمی هستیم. در شرایطی که کرونا جان ۷۰ هزار ایرانی را گرفته و آخوندهای قسی القلب از صدها میلیارد دلار دارایی های ربوده شده ملت ایران حتی حقوق پرستاران بیماران کرونایی را نمی دهند و در برابر اعتراض آنها با باتون و شوکر پاسخ می دهند، ما نیازی به سلاح اتمی نداریم. سلاح اتمی فقط برای باقی نگهداشتن ملایان در قدرت است بنابراین آنچه در نطنز واقع شده واکنش به پروژه اتمی فاشیسم دینی حاکم بر ایران است که برای مردم ایران فقط فقر و سرکوب و تروریسم و جنگ به ارمغان آورده است. این رژیم با سلاح اتمی تهدیدی برای مردم ایران، جامعه بین المللی و بشریت معاصر است.
به همین خاطر مقاومت ایران در مرداد ۱۳۸۱ سایتهای مخفی اتمی نطنز و اراک را برای نخستین بار فاش کرد، به استحضار مردم ایران رساند و در برابر انظار جهانیان و سازمان ملل و شورای امنیت ملل متحد قرار داد.