چهره پرصلابت و مهربان ایشان را از زمانهای دور که در دانشگاه پهلوی سابق ریاست دپارتمان فیزیک را عهده دار بود به خوبی به یاد می آورم. وی کرسی استادی دانشگاه پنسیلوانیا را رها کرد و به ایران بازگشت تا دانشش را در خدمت جوانان آن روزگاران بگذارد. به همت او بود که بزرگترین رصدخانه ایران به نام  ابوریحان بیرونی در  دانشگاه شیراز تاسیس گردید. وی از همان زمان به عنوان یک استاد بسیار برجسته و توانمند که زیر بار فشارهای طاقت فرسای آن دوران ساواک علیه استادان و دانشجویان به هیچوجه کمر خم نمی کرد و با آن چهره مهربان و ظاهری بسیار آراسته و لهجه شیرین زنجانی با پیپ خوش بویی بر لب، با جدیت تمام به تدریسی که همراه با شوق و شور و عشقی وافر به دانشجویان بود همت می گمارد و بدینوسیله محبوب القلوب عموم دانشجویان آن دانشگاه  گشته بود. همه می دانستند که او از کرسیهای استادی خود در اروپا، آمریکا و کانادا صرفاً به خاطر خدمت در سرزمین مادری چشم پوشیده بود و در شیراز با امکانات معمولی یک استاد آن دوران با شور و اشتیاق به تدریس و تطبع علمی مشغول بود. در دوران پرتلاطم قیام نیز برخلاف بسیاری که به سرعت راهی غرب شدند، در سنگر دانشگاه و در کنار دانشجویانش ماند و  ایستادگی کرد.  به یمن پایداری و شخصیت والای علمی وی بود که دانشکده علوم و ادبیات به خصوص دپارتمان فیزیک این دانشکده واقع در حافظیه شیراز ،مأمنی برای دانشجویان و استادان مبارز آن روزگاران گشته بود.
و اما در راستای سیاست جنایتکارانه پاکسازی دولت سرکوبگر احمدی نژاد در دانشگاه تحصیلات تکمیلی علوم پایه که به همت این دانشمند نامدار در شهر زادگاهش بنا نهاده شده و بیش از بیست سال از دخالت و حضور نیروهای بسیج و پاسداران سرکوبگر در امان مانده بود، کامران دانشحو، وزیر بیسواد علوم و آموزش عالی احمدی نژاد طی حکمی وی را از این سمت معزول و رسول خدابخش را به عنوان جایگزین وی منصوب کرد. روز یکشنبه گذشته قرار بود جلسه تودیع و معارفه ای با حضور وی و رئیس جدید که طبعا دست نشانده رژیم می باشد و این وزیر بی کفایت در این دانشگاه برگزار شود. درست برخلاف معمول، این عزل و نصب خائنانه مورد اعتراض شدید دانشجویان و سایر استادان شریف این دانشگاه واقع شد. آنها با شعارهای کوبنده و پخش تراکت خواهان ابقای پروفسور محبوب خویش بودند. در این تظاهرات که جمعی از مردم آزاده زنجان هم به خاطر اعتراض به این عمل شنیع دولت به دانشجویان معترض پیوسته بودند نیروهای سرکوبگر امنیتی با آنها و دانشجویان متحصن با خشونت و ضرب و شتم رفتار کردند. به هر روی به دلیل این ازدحام مراسم تودیع در آنروز برگزار نگردید و به روز بعد موکول شد. بنا به گزارش دانشجونیوز، مراسم روز دوشنبه در جوی به شدت امنیتی برگزار گردید. دکتر ثبوتی به نشانه اعتراض در جلسه تودیع خویش حضور نیافت. استاندار مزدور زنجان در بدو ورود به دانشگاه، دانشجویان متحصن را مورد تهدید و توهین قرار داده و با فحاشی لمپنی که ادبیات مرسوم دولت حاکم است اعلام کرده "من از روی جسد شما عبور کرده و مراسم تودیع را برگزار میکنم! چه کسی می گوید این دانشگاه مشکلی ندارد!؟ دانشگاهی که نه بسیج و نه حراست ندارد قطعا مشکل دارد!" گفته می‌شود نیروهای حراست کلیه دانشگاه‌های زنجان تامین امنیت مراسم تودیع و معارفه خشونت آمیز را به عهده داشته اند. اخباری  نیز از برخوردهای پراکنده بین دانشجویان و نیروهای امنیتی در سطح مختلف دانشگاه گزارش شده است!
شایان ذکر است که پروفسور ثبوتی در سال 1380 به دلیل خدمات علمی درخشانش طی نیم قرن گذشته به عنوان  "چهره ماندگار علم و فرهنگ ایران "برگزیده شد. درسال 2000 میلادی به دلیل فعالیتهای مستمر برجسته علمی به دریافت مدال ویژه آکادمی علوم جهان سوم نائل شد.
وی همچنین در سال  2002 از سوی سازمان یونسکو به‌عنوان پژوهشگر برگزیده رشته فیزیک جهان معرفی شد،
فعالیت وی در دانشگاه شیراز سرآغاز تحولات جدیدی در دستگاه آموزش عالی ایران بود.
نظام ترمی- واحدی کنونی از دستاوردهای دکتر ثبوتی برای نظام آموزشی کشور است.
این فیزیکدان سرشناس ایرانی و مؤسس مرکز تحصیلات تکمیلی علوم پایه زنجان دارای پیشینه علمی زیر است و از وی بیش از 60 رساله علمی در جهان منتشر شده است: استادیار بخش ریاضی دانشگاه نیوکاسل، دانشیار بخش فیزیک دانشگاه شیراز، ‏‏‏‎‏‎ْدانشیار مدعو بخش نجوم دانشگاه پنسیلوانیا، استاد فیزیک دانشگاه شیراز، محقق ارشد انستیتوی نجوم و اختر فیزیک دانشگاه آمستردام، هلند، محقق مدعو مرکز نجوم و اختر فیزیک دانشگاه شیکاگو، استاد مدعو بخش فیزیک دانشگاه نورث ایسترن بوستون امریکا، عضو وابسته مرکز بین‌المللی فیزیک نظری (تریست ایتالیا)است..
معمولا در دانشگاههای معتبر جهان رسم بر آنست که استادان اساسا بعد از رسیدن به سن بازنشستگی هم مجددا از سوی دانشگاه دعوت به همکاری شده و به کار تدریس و تحقیق خود ادامه می دهند. این امر در مورد پزشکان نیز صادق است. اما این رژیم علاوه بر بازنشستگی زودرس  و بازخرید اجباری و اخراج اساتید دگراندیش و غیرخودی مرتکب این جنایت فرهنگی و علمی عظیم نیز می شود.
برخورد دانشگاهیان و اقشار دانش پژوه با رژیم دانش ستیز به همین جا ختم نمی شود، در اقدام شجاعانه و در خور تقدیر دیگری، اساتید دانشگاه صنعتی شریف در برابر رئیس کمیسیون ضد فرهنگی مجلس ارتجاع بار دیگر وحدت دانشجو و استادان متعهد وآگاه ایران را به ثبوت رساندند. بنا به خبری که سایت آتی نیوز منتشر کرده هنگام اعلام سخنرانی "خود خواسته" حداد عادل که در لیست سخنرانان مراسم تودیع دیگری در دانشگاه شریف نبوده، ۵۰ تن از اعضای هیات علمی دانشگاه همزمان محل سالن را ترک کرده و دیگر به محل بر نگشتند. این اقدام شجاعانه نشانگر این واقعیت است که از نظر قشر آگاه و آزاد اندیش دانشگاهی ایران، دانشگاه جای کارگزاران ولی فقیه نیست.
ولی فقیه ارتجاع اخیراً طی یک سخنرانی مبتذل وظایف "مکتبی" و
 "اصولی"!! دانشگاهیان را در جهت حفظ نظام ولایت جهل و جنایت خود خاطرنشان کرد و تصریح نمود که همه باید در داخل آن دایره باطل و قرمز ولایت قرار بگیرند وگرنه خارج از این گردونه واقع شده و دشمن تلقی می شوند! به همین دلیل است که استادان و دانشمندان و متفکران که سرمایه های علمی و معنوی ایران دربند را اینچنین به بند می کشند و دستگاه علمی و آموزشی کشور را فلج می سازند با این خیال باطل که بتوانند با انقباض هر چه ببشتر مانع از سرنگونی محتوم خویش شوند.
در شرایطی که هر نغمه و نجوای مخالفی را در گلو خفه می کنند و دانشجویان شجاع و قهرمان را به اتهام واهی محاربه به مسلخ می کشند، و هنرمندان نامدار و مردمی در مقابل ارتجاع و این جنایات اخیر صف آرایی می کنند، در راستای همان ترهات ابلهانه خامنه ای اندر باب هنر موسیقی، مشتی مجیزگوی فرومایه، در ستایش خونریزان هنرکش ننگ ابدی را برای خویش می خرند. از آن زمره جاهل و عربده کش دست چندمی به نام علیرضا افتخاری که سابقه قتل یک انسان بیگناه در اصفهان را دارد و موارد انکارناپذیر دیگری از تجاوز به عنف نیز در زمان پاسداری در کارنامه ننگینش گزارش می شود، در حاشیه میهمانی مفتصح اخیر خامنه ای برای جلب و جذب مشتی افراد اجیر شده، تحت عنوان همایش ایرانیان خارجه نشین! طی برخوردی با پاسدار هزار تیر احمدی نژاد، او را که از جنس پلید خویش است آخوندوار درآغوش گرفته و همان چرندیاتی را در ستایش وی نثارش کرده که همگان از آن مطلعند و نگارنده از تکرار آن ابتذال میگذرم . از آن بدتر و چندش آورتر، پاسخ احمقانه این گماشته ولی فقیه در ازای خوش خدمتی این مزدور بیشرم در تحریم موسیقی و آلات موسیقی است که مؤید بلاهت و دجالگری این رئیس جمهور ارتجاع است که عین آنرا از رسانه های رسمی رژیم در زیر از نظرتان میگذرانم تا بخندید و بخوانید حدیث مفصل از این مجمل! 
علیرضا افتخاری گفت که قصد دارد از این پس برنامه هایش را بدون کمک گرفتن از آلات حرام موسیقی اجرا کند.
به گزارش خبرگزاری فارس، در جریان برگزاری مراسم روز خبرنگار،  احمدی نژاد، در هنگام سخنرانی، از مواضع علیرضا افتخاری تجلیل کرده و گفت: «پس از انتخابات، عده ای که آرزوهای خود را نقش بر آب می دیدند دست به آشوب زدند. یکی از این آشوب طلبان، فردی بود که ادعا می کند در موسیقی و آواز سنتی بی رقیب است حال آن که نظر سنجی های دولت نشان می دهد که تعداد طرفداران استاد افتخاری، دهها برابر بیشتر از ایشان است. وانگهی همه اعضای هیئت دولت، شورای نگهبان، مجلس شورای اسلامی، مجلس خبرگان و البته تمامی ائمه جمعه به این نکته اذعان دارند که صدای استاد افتخاری بسیار شیرین تر و دلنشین تر از صدای آن شخص است.
احمدی نژاد گفت: «همه می دانیم که نظر مقام معظم رهبری و سایر مراجع محترم این است که فراگیری و نواختن آلات موسیقی حرام است. بنده می خواهم این مژده را به شما بدهم که استاد افتخاری قصد دارند از این پس تمامی آوازهایشان را بدون کمک گرفتن از این آلات حرام اجرا کنند این در حالی است که آن خواننده که کلی ادعا دارد، تا در برنامه هایش اُرگ و جاز نباشد حتی یک بیت هم نمی خواند».
خبرگزاری فارس سپس سخنان مهوع علیرضا افتخاری را در این مراسم نقل کرد که پس از قدردانی از زحمات احمدی نژاد گفت: همانگونه که ایشان فرمودند من به سبب احترام به ولی امر مسلمین جهان و مراجع محترم تصمیم گرفته ام از این پس برنامه هایم را بدون کمک گرفتن از آلات حرام موسیقی اجرا کنم. شاید در وهله  اول این موضوع کمی عجیب و غیر ممکن به نظر بیاید اما بنده برای این مشکل چاره ای اندیشیده ام. من تعدادی هنرمند که استاد تقلید صدا هستند را استخدام کرده ام و در هنگام اجرای مراسم، هر کدام از آنها با دهانشان صدای یکی از آلات موسیقی را بیرون می آورند و بدین ترتیب هم موسیقی سنتی ما اصالتش حفظ خواهد شد و هم فرمان رهبر معظم انقلاب اجرا می شود"!!!.
در این مسیر دانش ستیزی و سرکوب دانشگاهیان و خصومت ماهوی با هر آنچه از آن صبغه ای از عنصر آگاهی و ادراک و پیشرفت فکر و اندیشه دارد، شاهد این ضایعه دردناک هم هستیم که علمای!! فاسد دین فروش پا را از گلیم متعفن، مندرس و فرسوده فکرهای منجمد و مخبط خود دراز تر کرده و با بلاهت تمام به نفی و مردود دانستن علوم انسانی و اجتماعی که در ردیف عالیترین دستاورد دانش بشر امروزیست پرداخته اند و به این بهانه که خداوند همه چیز را در قران کریم بیان کرده دیگر نیازی به تحصیل این قبیل رشته های علمی در دانشگاه نداریم!؟ و درست در همین راستا خامنه ای منحط در حرام بودن موسیقی و آموزش موسیقی برای کودکان فتاوی چندش آور و مضحکی صادر میکند و در یک نمایش مضحک بر افکار پوسیده و فاسد خود اصرار میورزد! . باید به این جانیان گفت که با این ترفندهای کهنه آب رفته و هرز شده به جوی ولایت باز نخواهد گشت و برای شما جانیان سیه دل و قسی و شقی راه و چشم اندازی جز نیستی و هلاکت متصور نیست!