آنها طی مدت دستگیری تحت شکنجه و بدرفتاری قرار داشتند و در اعتراض به دستگیری شان در اعتصاب غذا بسر میبردند. با توجه به اطلاعات مشابه دریافت شده، این 36 تن ابتدا به ایستگاه پلیس که از قرارگاه 25 کیلومتر فاصله داشت، منتقل شدند،. سپس با نقض آشکار دستور قضایی صادر شده ازسوی قاضی تحقیق در شهر خالص که حکم به آزادی آنها داده بود، به یک پایگاه نظامی در بغداد منتقل شدند.
سازمان جهانی علیه شکنجه یادآوری میکند که حدود 3،500 تن از اعضای سازمان مجاهدین خلق ایران گروه اپوزیسیون ایرانی، به دلایل سیاسی و به منظور خلاصی از آزار و اذیت و مقاومت در برابر رژیم ایران، از سال 1986 در قرارگاه اشرف بسر می برند.
در آوریل 2009، نیروهای امنیتی عراق به دنبال اظهارات چند نفر از مقامات ایرانی و عراقی مبنی بر این که اعضای سازمان مجاهدین خلق باید از عراق اخراج شوند و قرارگاه بسته شود، آنجا را محاصره کردند. این درحالی بود که افراد آن جا به عنوان "افراد حفاظت شده" بر اساس ماده 27 کنوانسیون چهارم ژنو شناخته شدهاند و تعهدات ناشی از آن توسط نیروهای ایالات متحده امضا و به روشنی قید شده است.
در 28 ژوئیه 2009 نیروهای امنیتی عراق به قرارگاه اشرف با بولدوزر وارد شدند. در این حمله که با استفاده از نارنجک، گاز اشکآور، ماشین آبپاش و گاز فلفل علیه ساکنان اشرف صورت گرفت، یازده تن کشته شدند و چندین نفر زخمی شدند.
با درنظر گرفتن این رویدادها، سازمان جهانی علیه شکنجه فراخوانهای قبلی خود را تکرار میکند: به مقامات عراق فراخوان میدهد ک: ساکنان کمپ اشرف نبایستی با زور به ایران بازگردانده شوند ، زیرا که در آنجا در معرض خطر شکنجه و بدرفتاریهای دیگر قرار میگیرند،
به مقامات ایالات متحده آمریکا فراخوان میدهد: به منظور کسب اطمینان از حفاظت مؤثر از قرارگاه اشرف ، تا هنگام استقرار یک نیروی بین المللی، به فوریت مسئولیت حفاظت، به نیروهای ایالات متحده منتقل شود.
به سازمان ملل متحد فراخون میدهد: یک نماینده جهت جمعآوری اطلاعات در مورد وضعیت در قرارگاه اشرف و به منظور اطلاع دادن به نهادهای حقوق بشر مربوطه در سازمان ملل متحد، از جمله شورای حقوق بشر، اعزا م شود.
از نماینده ویژه دبیر کل ملل متحد برای عراق و از هیأت ملل متحد برای مأموریت کمکرسانی در عراق (یونامی) موکدا می خواهد که برای راه اندازی یک حضور دائمی در کمپ به منظور نظارت و حفاظت از وضعیت اقدام کند و یک تصمیم فوری برای انجام تحقیقات بین المللی درمورد نقض حقوقبشر چه در جریان حمله 28ژوئیه و چه پس از آن حمله، اتخاذ شود.