منتظری طی فتوای جدیدی دربارة اعدام های اخیر در ایران، این اعدام ها را غیر شرعی و فاقد اصول فقهی لازم دانست.  تلویزیون العربیه (21آبان88)طی گزارشی در این مورد گفت:

منتظری گفت: مسئولین اجرای احکام اعدام و کسانی که به گرفتن این اعترافات فرمان می دهند، بر اساس شرع و قانون، گناهکار و جنایتکار  هستند.  

منتظری افزود احکامی که بر اساس اعترافاتی که به زور و شکنجه از متهمین گرفته شده، غیر شرعی و باطل هستند.